НФаУ является одной из ведущих научных учреждений, где осуществляется весь комплекс научно-исследовательских работ по созданию лекарственных средств в виде различных лекарственных форм: от поисковых исследований до разработки научно-технической документации и внедрения в производство и медицинскую практику.
Над разработкой лекарственных средств работают кафедры университета и лаборатории: Центральная научно-исследовательская лаборатория, Государственная научно-исследовательская лаборатория по контролю качества лекарственных средств, Клинико-диагностический центр с лабораторией клинической диагностики, Проблемная лаборатория морфофункциональных исследований, Научно-исследовательская лаборатория микробиологических и иммунологических исследований; Научно-исследовательская лаборатория парентеральных и оральных жидких лекарственных средств.
Кроме того, с целью эффективной разработки и внедрения отечественных конкурентоспособных научных и научно-прикладных разработок на мировом уровне приказом ректора НФаУ № 1088 к от 01.12.2016 г. в структуре Государственной научно-исследовательской лаборатории по контролю качества лекарственных средств НФаУ создан сектор фармакокинетических исследований и биоэквивалентности.
Создан целый ряд препаратов на основе новых биологически активных субстанций, синтезированных на кафедрах и в лабораториях химического профиля. Оригинальные малотоксичные препараты разработаны на базе компонентов растительного и животного происхождения, на основе продуктов пчеловодства. Итогом научной деятельности многих лет стало создание 161 лекарственных средств широкого спектра фармакологического действия, которые находятся сегодня на различных этапах внедрения:
| 2017 г. | Количество |
| Освоено (планируется, апробировано) промышленное производство или включено в перспективный план развития производства | 24 |
| Изготавливается в условиях аптеки | 2 |
| 2 фаза клинических испытаний | 5 |
| Завершены доклинические исследования | 28 |
| 1 фаза клинических испытаний | 5 |
| Продолжаются доклинические исследования оригинальных лекарственных препаратов | 52 |
| Новые лекарственные препараты, начали разрабатываться | 45 |
Научные разработки Национального фармацевтического университета. Лекарственные средства. Справочник . 1991-2010
Справочник содержит перечень и краткие сведения о лекарственных средствах синтетического и природного происхождения, разработанных или находящихся на стадии разработки в НФаУ за период с 1991 по 2010 год. В 6 разделе данного справочника приведен перечень патентов, обеспечивающих правовую защиту представленных лекарственных средств и биологически активных субстанций. Также представлены разработки лекарственных средств, сделанные в сотрудничестве с другими организациями.