Національний фармацевтичний університет є членом наступних міжнародних асоціацій та проєктів:
Велика Хартія Університетів (MagnaChartaUniversitatum)
Європейська Асоціація фармацевтичних факультетів (EAFP)
Всеукраїнська мережа з визнання іноземних освітніх кваліфікацій
Ukrainian Recognition Network (UaReNet)
В.о. ректора Котвіцька Алла Анатоліївна у 2023 році набула членство у Європейській асоціації жінок-ректорів (EWORA)
