Національний фармацевтичний університет щороку бере участь у міжнародних рейтингах Times Higher Education, QS та GreenMetric World University Rankings.
У 2021 році НФаУ було вперше включено до рейтингу QS Emerging Europe and Central Asia (EECA) University Rankings 2022 з позицією 251-300 з 450 ЗВО Європи та 16 позицією з 38 ЗВО України.
Також з 2021 року НФаУ бере участь у UI GreenMetric World University Rankings. У 2024 році отримано 1332 місце із 1477 ЗВО світу (24 з 25 представлених ЗВО України).
За результатами Times Higher Education Impact Rankings у 2023 році НФаУ отримав 47,5 зі 100 можливих балів. Це відповідає 1000+ позиції з 1591 установи, проранжованої цього року.
У 2025 році НФаУ вперше включено до Times Higher Education World University Rankings за спеціальним запрошенням від укладачів рейтингу у статусі Reporter.
